Gesucht wird zur Verstärkung unseres Teams im Referat „eScience“ in Berlin-Steglitz zum nächstmöglichen Zeitpunkt ein*e

Entgeltgruppe 14 TVöD
Zeitvertrag für 36 Monate
Vollzeit/teilzeitgeeignet

Die Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM) ist eine wissenschaftlich-technische Bundesoberbehörde mit Sitz in Berlin. Als Ressortforschungseinrichtung des Bundesministeriums für Wirtschaft und Klimaschutz forschen, prüfen und beraten wir zum Schutz von Menschen, Umwelt und Sachgütern. Im Fokus unserer Tätigkeiten in der Materialwissenschaft, der Werkstofftechnik und der Chemie steht dabei die technische Sicherheit von Produkten und Prozessen.

Wir suchen eine*n hochmotivierte*n Postdoktorand*in, die*der unser Team verstärkt und zur Weiterentwicklung computergestützter Methoden für die nicht-zielgerichtete Metabolomik beiträgt. Der Schwerpunkt dieser Position liegt auf der Weiterentwicklung von Fiora, einem Open-Source-Algorithmus, der Graph-Neuronale-Netzwerke nutzt, um Tandem-Massenspektren in silico zu simulieren. Fiora hat bereits überragende Leistungen im Vergleich zu den neuesten Technologien gezeigt und bietet präzise Vorhersagen von Fragmentionenintensitäten, Retentionszeiten und Kollisionsquerschnitten. Durch GPU-Optimierung ermöglicht Fiora schnelle und großskalige Spektralsimulationen zur Erweiterung von Referenzbibliotheken und zur Verbesserung der Identifizierung von Verbindungen in Metabolomik-Studien. Die*Der erfolgreiche Bewerber*in wird mit eigenen Ideen die Weiterentwicklung der Methodik leiten, ihn mit Benchmark-Datensätzen wie NIST, MS-Dial und CASMI-Challenges validieren sowie in Workflows zur Biomarker-Entdeckung und Präzisionsmedizin integrieren. Wir suchen eine*n Kandidat*in mit einem Doktortitel in Computational Chemistry, Bioinformatik, Informatik oder einem verwandten Bereich, mit starken Programmierfähigkeiten und Erfahrung im Bereich Maschinelles Lernen.

Als Mitglied der eScience-Gruppe sind Sie Teil eines interdisziplinären Umfelds mit kreativen Köpfen. Wir bieten ein breites Spektrum an anspruchsvollen Aufgaben an der Schnittstelle von Informatik, Data Science und Materialforschung. Unser Team ist bekannt für seine Vielfalt und seine Energie. Dies ist Ihre Chance, mit internationalen, jungen, innovativen Fachleuten zusammenzuarbeiten, die sich zusammengefunden haben, um die Digitalisierung der Materialforschung zu gestalten!

• Entwicklung neuer maschineller Lernmodelle für Anwendungen in der Materialwissenschaft
• Weiterentwicklung komplexer Modelle des Maschinellen Lernens in PyTorch
• Aufbereitung von Trainingsdaten sowie Entwicklung und Auswahl geeigneter Merkmale (Features)
• Visualisierung und Interpretation der Ergebnisse aus den Vorhersagen
• Betreuung von Nachwuchswissenschaftler*innen
• Präsentation von Forschungsergebnissen auf wissenschaftlichen Konferenzen und in begutachteten Fachzeitschriften

• Erfolgreich abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Diplom/Master) sowie sehr gute Promotion der Informatik, technischen Softwareentwicklung, Bioinformatik, Mathematik, Physik, Data Engineering oder vergleichbar
• Sehr gute Kenntnisse von Softwarebibliotheken für Data Science (z. B. PyTorch, PyTorch-Geometric, Pandas, Scitkit-Learn)
• Sehr gute Kenntnisse moderner Methoden des Maschinellen Lernens (z. B. Invertible Neural Networks und Graph Neural Networks)
• Sehr gute Kenntnisse in mindestens einer Programmiersprache (z. B. Python, Rust, Go)
• Erfahrung mit der Analyse von Tandem-Massenspektren ist wünschenswert
• Erfahrung mit Versionskontrollsystemen (z. B. Git) ist wünschenswert
• Erfahrung mit statistischen Methoden ist wünschenswert
• Kenntnisse von Methoden zur Verarbeitung und Analyse großer Datenmengen sind wünschenswert
• Erfahrungen mit Daten aus dem Bereich der Material- oder Ingenieurwissenschaften oder Naturwissenschaften sind wünschenswert
• Ausgezeichnete mündliche und schriftliche Sprachkenntnisse/Ausdrucksstärke in Englisch
• Ausgezeichnete kommunikative und zwischenmenschliche Fähigkeiten, eine zielorientierte und strukturierte Arbeitsweise, mit einer starken Bereitschaft zur Kooperation und Zusammenarbeit mit anderen, Lern- und Anpassungsbereitschaft sowie ausgeprägtes konzeptionelles, strategisches und innovatives Denken

• Interdisziplinäre Pionierforschung an der Schnittstelle von Politik, Wirtschaft und Gesellschaft
• Arbeit in führenden nationalen und internationalen Netzwerken mit Universitäten, Forschungseinrichtungen und Industrieunternehmen
• Zugang zu exzellenter Ausstattung und Infrastruktur
• Flexible Arbeitszeiten, mobiles Arbeiten und eine gute Work-Life-Balance mit 30 Urlaubstagen und bis zu 12Gleittagen pro Jahr
• Persönliche und berufliche Weiterentwicklung
• Sie profitieren von einer wertschätzenden und integrativen Atmosphäre mit einer zertifizierten familienfreundlichen Arbeitskultur, regelmäßigem Feedback und einem starken Engagement für die Gleichstellung und Integration von schwerbehinderten Menschen.